MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	A	7	7	3	9	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015562	TTAA	2	8	10	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015562	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
4	NC_015562	TTTA	2	8	64	71	25 %	75 %	0 %	0 %	333909895
5	NC_015562	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
6	NC_015562	TAT	3	9	145	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
7	NC_015562	A	6	6	177	182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015562	ATT	2	6	204	209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015562	T	6	6	215	220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015562	TGA	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909896
11	NC_015562	CAAT	2	8	291	298	50 %	25 %	0 %	25 %	333909896
12	NC_015562	AT	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	333909896
13	NC_015562	TGCAAC	2	12	344	355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333909896
14	NC_015562	GCA	3	9	396	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
15	NC_015562	GCG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333909896
16	NC_015562	AGTC	3	12	543	554	25 %	25 %	25 %	25 %	333909896
17	NC_015562	AAT	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
18	NC_015562	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
19	NC_015562	AGAA	2	8	722	729	75 %	0 %	25 %	0 %	333909896
20	NC_015562	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
21	NC_015562	TTG	2	6	787	792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
22	NC_015562	A	6	6	832	837	100 %	0 %	0 %	0 %	333909896
23	NC_015562	TAA	2	6	847	852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
24	NC_015562	AAG	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909896
25	NC_015562	AGTT	2	8	871	878	25 %	50 %	25 %	0 %	333909896
26	NC_015562	GA	3	6	939	944	50 %	0 %	50 %	0 %	333909896
27	NC_015562	TA	3	6	994	999	50 %	50 %	0 %	0 %	333909896
28	NC_015562	GTT	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
29	NC_015562	AGC	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
30	NC_015562	ATC	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909896
31	NC_015562	AGCA	2	8	1063	1070	50 %	0 %	25 %	25 %	333909896
32	NC_015562	TGG	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909896
33	NC_015562	TTG	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
34	NC_015562	GCA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
35	NC_015562	AAGG	2	8	1118	1125	50 %	0 %	50 %	0 %	333909896
36	NC_015562	TAA	2	6	1228	1233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015562	T	6	6	1260	1265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015562	TTCA	2	8	1274	1281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015562	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015562	T	6	6	1315	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015562	T	7	7	1330	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015562	TTTTAT	2	12	1340	1351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015562	ATTC	2	8	1354	1361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015562	ATTT	2	8	1392	1399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015562	AAT	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015562	TGTA	2	8	1438	1445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015562	GTGA	2	8	1463	1470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015562	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
49	NC_015562	TAT	2	6	1491	1496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
50	NC_015562	TGCT	2	8	1497	1504	0 %	50 %	25 %	25 %	333909897
51	NC_015562	TTA	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
52	NC_015562	ATT	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
53	NC_015562	GTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
54	NC_015562	ATTAAA	2	12	1660	1671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909897
55	NC_015562	G	6	6	1694	1699	0 %	0 %	100 %	0 %	333909897
56	NC_015562	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
57	NC_015562	GA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	50 %	0 %	333909897
58	NC_015562	AAAC	2	8	1785	1792	75 %	0 %	0 %	25 %	333909897
59	NC_015562	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
60	NC_015562	AAAAG	2	10	1825	1834	80 %	0 %	20 %	0 %	333909897
61	NC_015562	AGT	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
62	NC_015562	TGT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
63	NC_015562	GTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
64	NC_015562	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
65	NC_015562	GCAT	2	8	2050	2057	25 %	25 %	25 %	25 %	333909897
66	NC_015562	AGA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
67	NC_015562	ATG	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
68	NC_015562	AAAATT	2	12	2281	2292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909897
69	NC_015562	AAG	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
70	NC_015562	AGA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
71	NC_015562	GAA	3	9	2333	2341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
72	NC_015562	ATGGAA	2	12	2415	2426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333909897
73	NC_015562	ATATGA	2	12	2449	2460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333909897
74	NC_015562	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
75	NC_015562	ATCA	2	8	2503	2510	50 %	25 %	0 %	25 %	333909897
76	NC_015562	ACA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
77	NC_015562	CAA	2	6	2535	2540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
78	NC_015562	TAC	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
79	NC_015562	AGAT	2	8	2556	2563	50 %	25 %	25 %	0 %	333909897
80	NC_015562	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
81	NC_015562	GCA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909897
82	NC_015562	ATA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015562	ATTTTT	2	12	2762	2773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015562	T	7	7	2787	2793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015562	T	6	6	2800	2805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015562	ATT	2	6	2851	2856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015562	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015562	ATT	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015562	T	6	6	2915	2920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015562	T	6	6	2926	2931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015562	T	6	6	2939	2944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015562	T	6	6	2948	2953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015562	ATTTTT	2	12	2965	2976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015562	TAAA	2	8	3019	3026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015562	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015562	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015562	TTAA	2	8	3158	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015562	GTG	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015562	T	6	6	3269	3274	0 %	100 %	0 %	0 %	333909898
100	NC_015562	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
101	NC_015562	TTG	2	6	3428	3433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909898
102	NC_015562	T	6	6	3450	3455	0 %	100 %	0 %	0 %	333909898
103	NC_015562	ATC	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909898
104	NC_015562	AAAT	2	8	3550	3557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909898
105	NC_015562	CTT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909898
106	NC_015562	TCC	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
107	NC_015562	ACA	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909898
108	NC_015562	GCAT	2	8	3829	3836	25 %	25 %	25 %	25 %	333909898
109	NC_015562	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
110	NC_015562	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909899
111	NC_015562	ATCC	2	8	3921	3928	25 %	25 %	0 %	50 %	333909899
112	NC_015562	TTTC	2	8	3987	3994	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
113	NC_015562	T	6	6	4053	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	333909899
114	NC_015562	TC	3	6	4064	4069	0 %	50 %	0 %	50 %	333909899
115	NC_015562	TGA	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
116	NC_015562	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909899
117	NC_015562	CTT	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
118	NC_015562	TG	3	6	4195	4200	0 %	50 %	50 %	0 %	333909899
119	NC_015562	T	6	6	4264	4269	0 %	100 %	0 %	0 %	333909899
120	NC_015562	A	7	7	4355	4361	100 %	0 %	0 %	0 %	333909899
121	NC_015562	CTTT	2	8	4416	4423	0 %	75 %	0 %	25 %	333909899
122	NC_015562	A	6	6	4533	4538	100 %	0 %	0 %	0 %	333909899
123	NC_015562	AAC	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909899
124	NC_015562	T	6	6	4649	4654	0 %	100 %	0 %	0 %	333909899
125	NC_015562	TCT	2	6	4698	4703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
126	NC_015562	T	6	6	4743	4748	0 %	100 %	0 %	0 %	333909899
127	NC_015562	T	7	7	4766	4772	0 %	100 %	0 %	0 %	333909899
128	NC_015562	ATT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909899
129	NC_015562	TAAG	2	8	4850	4857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015562	TAAA	2	8	4866	4873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015562	AAG	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
132	NC_015562	ACA	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909900
133	NC_015562	AAGAG	2	10	4963	4972	60 %	0 %	40 %	0 %	333909900
134	NC_015562	AAT	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
135	NC_015562	TCA	3	9	5063	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
136	NC_015562	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
137	NC_015562	T	7	7	5151	5157	0 %	100 %	0 %	0 %	333909900
138	NC_015562	CT	3	6	5159	5164	0 %	50 %	0 %	50 %	333909900
139	NC_015562	GAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909900
140	NC_015562	AAGG	2	8	5195	5202	50 %	0 %	50 %	0 %	333909900
141	NC_015562	ATTGA	2	10	5219	5228	40 %	40 %	20 %	0 %	333909900
142	NC_015562	T	6	6	5245	5250	0 %	100 %	0 %	0 %	333909900
143	NC_015562	TAT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909900
144	NC_015562	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909900
145	NC_015562	GAA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
146	NC_015562	GAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
147	NC_015562	A	7	7	5372	5378	100 %	0 %	0 %	0 %	333909900
148	NC_015562	A	6	6	5431	5436	100 %	0 %	0 %	0 %	333909900
149	NC_015562	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
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151	NC_015562	AAAT	2	8	5550	5557	75 %	25 %	0 %	0 %	333909900
152	NC_015562	TAC	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
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155	NC_015562	TTCT	2	8	5665	5672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_015562	AAT	2	6	5683	5688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015562	TTG	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
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159	NC_015562	AGAT	2	8	5772	5779	50 %	25 %	25 %	0 %	333909901
160	NC_015562	ATGG	2	8	5813	5820	25 %	25 %	50 %	0 %	333909901
161	NC_015562	A	7	7	5845	5851	100 %	0 %	0 %	0 %	333909901
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187	NC_015562	GAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_015562	TAT	2	6	6528	6533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909902
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275	NC_015562	T	6	6	9771	9776	0 %	100 %	0 %	0 %	333909904
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279	NC_015562	CT	3	6	10004	10009	0 %	50 %	0 %	50 %	333909904
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